Ihmisen metyloitu NDRG4/SEPT9/SFRP2/BMP3/SDC2-geeni

Aikuisilla yli 108 suolen epiteelisolua putoaa suolen seinämästä joka päivä, ja ne erittyvät ulosteiden mukana paksusuolen peristaltiikan kautta.Koska kasvainsolut putoavat todennäköisemmin suolistosta epänormaalin lisääntymisen vuoksi, suolistokasvainpotilaiden uloste sisältää monia sairaita soluja ja epänormaalia solukomponenttia, mikä on materiaalinen perusta vakaalle ulosteen havaitsemiselle.Tutkimukset ovat osoittaneet, että geenipromoottorien metylaatiomodifiointi on varhainen tapahtuma tuumorigeneesissä, ja kolorektaalisyöpäpotilaiden ulostenäytteistä saatu geneettinen materiaali voi heijastaa syövän esiintymistä suolistossa aikaisemmin.

NDRG4, joka tunnetaan myös nimellä SMAP-8 ja BDM1, on yksi neljästä NDRG-geeniperheen (NDRG1-4) jäsenestä, jonka on osoitettu liittyvän solujen lisääntymiseen, erilaistumiseen, kehitykseen ja stressiin.On vahvistettu, että NDRG4-metylaatio on mahdollinen biomarkkeri paksusuolensyövän ei-invasiiviseen havaitsemiseen ulostenäytteistä.

SEPT9 on Septin-geeniperheen jäsen, joka koostuu vähintään 13 geenistä, jotka koodaavat konservoitunutta GTPaasidomeenia, joka voi sitoa sytoskeletoon liittyviä proteiineja, ja liittyy solun jakautumiseen ja tuumorigeneesiin.Tutkimukset ovat osoittaneet, että metyloidun Septin9-geenin pitoisuus on tyypillisesti lisääntynyt paksusuolen ja peräsuolen syöpäpotilaiden ulostenäytteissä.

Erittyneet frizzled-sukuiset proteiinit (sFRP:t) ovat liukoisia proteiineja, jotka ovat Wnt-reitin antagonistien luokkaa, koska niillä on korkea rakenteellinen homologia Wnt-signaloinnin frizzled-reseptorin (Fz) kanssa.SFRP-geenin inaktivointi johtaa kolorektaalisyöpään liittyvän Wnt-signaloinnin hallitsemattomaan aktivoitumiseen.Tällä hetkellä SFRP2-metylaatiota ulosteessa voidaan käyttää ei-invasiivisena biomarkkerina paksusuolensyövän diagnosoinnissa.

BMP3 on TGF-B-superperheen jäsen ja siksi sillä on tärkeä rooli alkion kehityksessä indusoimalla ja muokkaamalla varhaista luun muodostumista.BMP3 hypermetyloituu paksusuolensyövässä ja sitä voidaan käyttää tärkeänä kasvainmarkkerina.

SDC2 on solupinnan heparaanisulfaattiproteoglykaani, joka osallistuu monien fysiologisten ja patologisten prosessien säätelyyn.Fyysisesti prosessoituja ovat solujen lisääntyminen, erilaistuminen, adheesio, sytoskeletaalin organisoituminen, migraatio, haavan paraneminen, solu-matriisi-kommunikaatio, angiogeneesi;Patologisia prosesseja ovat tulehdus ja syöpä.SDC2-geenin metylaatiotaso paksusuolen syöpäkudoksissa oli merkittävästi korkeampi kuin normaaleissa kudoksissa.